جلال الدین حقانی، در زمان حکومت داود خان، نخستین رئیس جمهوری افغانستان در دهه پنجاه خورشیدی، به پاکستان رفت و در آنجا به حزب اسلامی به رهبری مولوی یونس خالص که علیه نیروهای شوروی سابق و دولت مورد حمایت آنها میجنگید، پیوست. سپس او در سال ۱۹۸۰ به کمک مالی ایالات متحده امریکا و برای راه اندازی عملیاتها و حملات چریکی علیه نیروهای ارتش سرخ در افغانستان شبکه حقانی را ایجاد کرد.